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[发明专利]一种基于单端测序的融合基因检测方法及其应用-CN201610881242.5有效
发明人：刘继龙;刘足;程少敏;郭凤明;叶明芝 -专利权人：广州华大基因医学检验所有限公司;广州华大基因科技有限公司
申请日： 2016-09-30 - 公布日： 2021-07-27 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本申请公开了一种基于单端测序的融合基因检测方法及其应用。本申请的融合基因检测方法包括，(1)设计融合基因第一基因的捕获探针，进行单端测序；(2)分析单端测序结果，获得第二基因强启动子测序深度；(3)将获得的强启动子测序深度与测序深度基线比较，如待测样品强启动子测序深度显著大于测序深度基线，判断待测样品发生基因融合突变，反之则未发生基因融合；测序深度基线为融合基因阴性样品的第二基因强启动子的测序深度基线。本申请的融合基因检测方法，将单端测序劣势变优势，提高了单端测序检测融合基因的敏感度，并且数据分析的时间短、效率高、数据利用率高、成本低。
一种基于单端测序融合基因检测方法及其应用

[发明专利]一种构建测序用DNA文库的方法-CN201510791719.6有效
发明人：陈重建;夏赟;彭琼芳;王占东;薛月寒;玄兆伶;李大为;梁峻彬 -专利权人：安诺优达基因科技（北京）有限公司;浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司
申请日： 2015-11-17 - 公布日： 2020-03-24 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：本发明涉及构建测序用DNA文库的方法、测序用DNA文库以及测序方法。所述构建测序用DNA文库的方法包括将平末端DNA片段中的至少一部分进行单3'端加A，得到单3'端加A的DNA片段的步骤；和将步骤B‑1中得到的单3'端加A的DNA片段进行平末端连接的步骤。
一种构建测序用 dna 文库方法

[发明专利]一种DNA测序装置及测序方法-CN201910612052.7在审
发明人：袁志山;王成勇 -专利权人：广东工业大学
申请日： 2019-07-08 - 公布日： 2019-11-15 - 主分类号： C12M1/42 文献下载
摘要：本发明公开一种DNA测序装置，包括三维纳米运动平台、探针、用于装夹固定探针的定位夹具及综合测序层，所述定位夹具固定于三维纳米运动平台上，所述综合测序层包括固态纳米孔芯片、液体池、磁镊系统、电源、电流测量装置及电极；本发明基于DNA测序装置还公开了一种DNA测序方法，克服了现有DNA测序装置在测序时，绑定大量的DNA单链而无法捕获到单条DNA，且仅能实现一端牵引DNA单链向上移动测序，造成测序过程中，溶液中的DNA易产生布朗运动的弊端，实现了高精度的DNA单碱基测序。
测序定位夹具纳米运动布朗运动三维电流测量装置测序过程固定探针固态纳米向上移动单碱基液体池电极绑定磁镊单条探针装夹捕获电源牵引芯片

[发明专利]提高条形码拆分率的测序方法和试剂盒-CN201910500621.9有效
发明人：王静静;罗银玲;龚梅花;李计广;徐崇钧;蒋慧 -专利权人：深圳华大智造科技股份有限公司
申请日： 2019-06-11 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：一种提高条形码拆分率的测序方法和试剂盒，该方法包括：提供插入片段测序引物、阻断的占位引物和待测模板，其中占位引物的3’端被阻断而不能延伸，且占位引物在待测模板上的杂交位置位于条形码测序引物杂交位置或其下游区域；将插入片段测序引物和占位引物杂交到待测模板上，对插入片段进行测序；在插入片段测序完成并阻断测序产物3’羟基端后，去除占位引物并杂交上条形码测序引物，或将占位引物的3’端恢复成3’羟基基团作为条形码测序引物，进行条形码测序。本发明的方法在不影响单端测序数据质量的前提下，解决单端测序读长超过插入片段长度而导致部分插入片段过短的序列不能被拆分出来的问题。
提高条形码拆分方法试剂盒

[发明专利]编码PCR二代测序建库方法、试剂盒及检测方法-CN201710102701.X有效
发明人：黄新华;戴慧清 -专利权人：金弗康生物科技（上海）股份有限公司
申请日： 2017-02-24 - 公布日： 2021-03-05 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种编码PCR二代测序建库方法，步骤包括：1)提取DNA；2)用带随机分子编码序列的单端特异引物进行正向单链线性扩增反应；3)用对侧单端特异引物与公共接头引物构成引物对，进行单端特异指数扩增反应；4)用测序双端公共接头引物对进行指数扩增反应；5)定量质检，获得DNA文库。本发明还公开了用上述DNA文库进行测序检测的方法，及包含该DNA文库的编码PCR二代测序建库试剂盒。本发明通过将样品原始DNA模板序列在初始互补合成中进行编码，使测序结果可以根据编码溯源检出初始DNA模板的真实序列和真实检出分子数，从而显著降低了突变假阳性和假阴性。
编码 pcr 二代测序建库方法试剂盒检测

[发明专利]一种单分子靶标基因建库方法及其试剂盒-CN202011533112.5在审
发明人：崔品 -专利权人：深圳市睿法生物科技有限公司
申请日： 2020-12-22 - 公布日： 2021-03-30 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：一种单分子靶标基因建库方法及其试剂盒，该方法包括：延伸步骤，包括将模板分子、串联有第一测序接头的靶标探针混合，靶标探针结合至模板分子的靶标区域并延伸，获得靶标探针延伸产物；第二测序接头连接步骤，包括加入第二测序接头，第二测序接头具有互补配对的正向链、反向链，正向链的5’端可串联连接至靶标探针延伸产物的3’端，反向链的3’端串联有随机序列，反应得到第二测序接头连接产物；解链处理，去除产物中串联有随机序列的单链分子，得到串联有第一测序接头的单链产物；双链合成步骤，包括加入第一引物、第二引物，反应得到扩增产物。本发明将建库与靶向基因富集整合，广泛适用于各种长度和高低起始量的单链或双链DNA样本。
一种分子靶标基因方法及其试剂盒

[发明专利]一种单分子靶标基因建库方法及其试剂盒-CN202111572277.8在审
发明人：崔品 -专利权人：深圳市睿法生物科技有限公司
申请日： 2021-12-21 - 公布日： 2022-03-22 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：一种单分子靶标基因建库方法及其试剂盒，该方法包括：延伸步骤，包括将模板分子、串联有第一测序接头的靶标探针混合，靶标探针结合至模板分子的靶标区域并延伸，获得靶标探针延伸产物；第二测序接头连接步骤，包括加入第二测序接头，第二测序接头具有互补配对的正向链、反向链，正向链的5’端可串联连接至靶标探针延伸产物的3’端，反向链的3’端串联有随机序列，反应得到第二测序接头连接产物；解链处理，去除产物中串联有随机序列的单链分子，得到串联有第一测序接头的单链产物；双链合成步骤，包括加入第一引物、第二引物，反应得到扩增产物。本发明将建库与靶向基因富集整合，广泛适用于各种长度和高低起始量的单链或双链DNA样本。
一种分子靶标基因方法及其试剂盒

[发明专利]高通量测序模板的原位复制及其增加阅读长度的测序方法-CN201110030788.7无效
发明人：肖鹏峰;陈婧;葛芹玉;陆祖宏 -专利权人：东南大学
申请日： 2011-01-28 - 公布日： 2011-08-03 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：高通量测序模板的原位复制及其增加阅读长度的测序方法，已经制备好的DNA测序模板，在测序得到一段序列片段后，将其变性为DNA单链－旧模板，再通过活化先前引入的延伸引物将其复制，并将旧模板全部切除后，得到与原来DNA测序模板完全互补的DNA单链－新模板，将这些DNA单链作为DNA测序模板进行序列测定，便得到与旧模板另一端、且互补的新测定序列，将新、旧模板测定的序列片段拼接，增加了测序模板的阅读长度，降低了短片段序列拼接的困难
通量模板原位复制及其增加阅读长度方法

[发明专利]可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用-CN201110291304.4有效
发明人：陆祖宏;杨琦;葛芹玉;潘旻;涂景 -专利权人：东南大学
申请日： 2011-09-29 - 公布日： 2012-07-11 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒，表面结合有多条单链核酸和一条双链核酸，所述双链核酸通过其中一条序列的一端与颗粒表面连接，并可作为双链接头与待测序核酸、以及末端双链接头顺序连接，然后变性形成一条单链核酸分子模板，所述单链核酸分子模板可以以颗粒表面的单链核酸作为引物进行有效PCR扩增，在颗粒表面形成多条双链测序模板，再将所述多条双链测序模板转化为多条单链测序模板后用于检测待测序核酸的信息。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒的制备方法为：(1)使单链核酸连接到所述颗粒表面；(2)使所述每颗颗粒表面至多连接一条双链核酸。
进行分子核酸扩增颗粒制备方法应用

[发明专利]用于二代测序质量评估的文库、试剂及应用-CN201711330411.7有效
发明人：廖莎;闫东东;章文蔚;徐崇钧;陈奥;陈莹;赵杰;许军强;傅德丰;何琳 -专利权人：深圳华大智造科技股份有限公司
申请日： 2017-12-13 - 公布日： 2022-01-04 - 主分类号： C40B40/06 文献下载
摘要：本申请公开了一种用于二代测序质量评估的文库、试剂及应用。本申请的文库为具有不同碱基特征的已知序列的单链DNA文库，在文库中连接有接头序列和索引序列；单链DNA文库包括高AT含量单链DNA、高GC含量单链DNA、poly结构单链DNA和发夹结构单链DNA中的至少一种本申请文库，采用具有不同碱基特征的已知序列测序，可评估不同碱基特征对测序的影响和偏差，实现测序质量评估，纠正这些偏差，实现测序优化。本申请提高核酸测序准确性的方法，通过比较测序结果和已知序列，获得不同碱基特征的测序偏差，指导测序软件算法改善，提高测序准确性；本申请方法，能有效减少测序偏差，为提高测序准确性提供了一种简单有效的方法。
用于二代质量评估文库试剂应用

[发明专利]一种3’端羟基可逆封闭核苷酸合成测序法-CN202011152063.0有效
发明人：肖鹏锋;成楚 -专利权人：东南大学
申请日： 2020-10-23 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种3’端羟基可逆封闭核苷酸合成测序法，包括单色标记或单次扫描双色标记核苷酸合成测序。单色标记测序：四种3’端羟基可逆封闭的脱氧核苷酸单体中X、Y两个不同的脱氧核苷酸单体用同一种标记物标记记为X*、Y*，另外两个脱氧核苷酸Z、W不标记，每次测序反应最多产生一个核苷酸的合成，比较标记物信息强度与背景数值，得到一个测序编码信息XY或者ZW，然后活化3’端羟基进行下一个测序反应，并获得由(XY)、(WZ)这些编码构成测序信息；单次扫描双色标记测序：将上述四种脱氧核苷酸单体分两组分别进行不同标记，进行奇数和偶数次的单次测序，分别得到两组编码，通过比较两组编码中选出相同的碱基即完成对测序信息的解码，得到具体的碱基信息。
一种羟基可逆封闭核苷酸合成测序法

[发明专利]一种双标签接头设计方法及制备方法-CN201910237765.X在审
发明人：郑建超;汪宇盈;羊光辉;叶明芝 -专利权人：华大数极生物科技（深圳）有限公司
申请日： 2019-03-27 - 公布日： 2020-10-09 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供了一种构建待测DNA分子测序文库的试剂盒，包括双样本标签接头；所述双样本标签接头由接头序列L和接头序列S退火形成接头；所述双样本标签接头的一端用于连接待测DNA分子；本发明有以下几种优势：1)通过在紧邻插入DNA片段两端引入新的样本标签，减少测序引物的加入次数，降低测序成本；2)本发明还能够在不增加测序成本的情况下，让单端测序项目实现双样本标签，避免样本标签串扰带来的假阳性问题。这种接头设计方案，可以满足单端测序即可实现双样本标签，可以实现对样本标签串扰产生错误测序数据的过滤。
一种标签接头设计方法制备

[发明专利]构建测序文库的方法及其应用-CN201410521540.4有效
发明人：管彦芳;钱朝阳;吕小星;常连鹏;易鑫;朱红梅;杨玲;吴仁花 -专利权人：天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2014-09-30 - 公布日： 2017-07-28 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：公开了构建测序文库的方法及其应用，该方法包括(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头，以便获得连接产物；(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段；(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选；(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应，以便获得链延伸产物；(e)对所述链延伸产物进行扩增，以便获得扩增产物，所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
构建序文方法及其应用

[发明专利]构建测序文库的方法及其应用-CN201410519353.2有效
发明人：易鑫;吕小星;钱朝阳;管彦芳;杨玲;朱红梅 -专利权人：天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2014-09-30 - 公布日： 2017-04-19 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：公开了构建测序文库的方法及其应用，该方法包括(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头，以便获得连接产物；(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段；(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选；(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应，以便获得链延伸产物；(e)对所述链延伸产物进行扩增，以便获得扩增产物，所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
构建序文方法及其应用

[发明专利]构建测序文库的方法及其应用-CN201410520223.0有效
发明人：管彦芳;钱朝阳;吕小星;常连鹏;易鑫;朱红梅;杨玲;吴仁花 -专利权人：天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因科技有限公司
申请日： 2014-09-30 - 公布日： 2017-07-04 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：公开了构建测序文库的方法及其应用，该方法包括(a)在双链DNA片段的两端分别连接接头，以便获得连接产物；(b)将所述连接产物裂解为单链DNA片段；(c)利用探针对所述单链DNA片段进行筛选；(d)利用第一引物对所述单链DNA片段进行链延伸反应，以便获得链延伸产物；(e)对所述链延伸产物进行扩增，以便获得扩增产物，所述扩增产物构成所述测序文库。还公开了测序方法、确定核酸序列的方法、构建测序文库的装置、测序设备以及确定核酸序列的系统。
构建序文方法及其应用

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